Desa Pacalan memiliki sejarah yang sangat menarik untuk ditelusuri. Sejarah Desa Pacalan juga sangat berkaitan dengan cikal bakal kota Magetan. Di Pacalan terdapat makam bersejarah diantaranya :
1. MAKAM KY.AGENG KEMBANG SORE
2. MAKAM BUPATI MAGETAN KE II KRMT Poerwodiningrat/ Kj. KY Adipati Poerwodiningrat yg juga Merupakan Mertua dari Sri Sultan Hamengkubuwono ke II dan juga mertua  Adipati Pakualam Ke I.
3. MAKAM BUPATI Magetan ke III KRT. SOSRODIPURO

Konon katanya kota Magetan tak lepas andil oleh Raden Ki Mageti dan Raden Nolodipo atau yang lebih dikenal dengan KY.Ageng Kembang Sore. Beliau sangat terkenal memiliki kesaktian. Salah satu yang melegenda yaitu beliau mampu menanam Kembang (Bunga) di pagi hari dan sore harinya sudah mampu mekar. Selain hal tersebut, Konon pada jaman dahulu, makam beliau tak pernah dijatuhi guguran daun kering, padahal letak makamnya dikelilingi oleh pohon yang lebat. Bupati ke-II dan ke-III Magetan juga merupakan murid KY.Ageng Kembang Sore